1、运行速度不同：G字头高铁时速，300-350km/h,D字头动车时速，200-250km/h。

2、运行轨道不同：高铁对轨道要求高，轨道一般采用无砟轨道，无砟轨道是指采用混凝土、沥青混合料等整体基础取代散粒碎石道床的轨道结构，又称作无碴轨道，是当今世界先进的轨道技术。而且高铁线路一般采用100m轨道，轨道连接处需要进行焊接和打磨，处理成很平顺的轨道，所以高铁基本在新建的铁路上运行。动车既可以在有砟轨道上运行，也可以在新建高铁的无砟轨道上运行。

3、车次标识不同：G字头的车次是高铁,D字头的车次是动车,而且一般高铁的票价比动车贵。