1、蜥蜴大部分的种类为肉食性，以昆虫、蚯蚓、蜗牛甚至老鼠等为食，但也有以仙人掌或海藻为主食或是杂食性的。壁虎类夜晚活动，以鳞翅目等昆虫为食物。体型较大的蜥蜴如大壁虎也可以吃小鸟及其他蜥蜴。

2、巨蜥则可吃鱼、蛙甚至捕食小型哺乳动物。也有一部分蜥蜴如鬣蜥以植物性食物为主。由于大多数种类捕吃大量昆虫，蜥蜴在控制害虫方面所起的作用是不可低估的。