新农合和医保两者的区别主要有以下的三大点：

　　１、新农村合作医疗是农村户口的买，居民医疗保险是非农业户口的买。

　　２、新农合主要是让农民在乡镇卫生院报销得多，起付线低，在城里的医院报得相对比较少；居民医疗保险起付线比新农合稍高，在大医院报销比例稍高一些，交钱也就相应的多缴一些。

　　３、新农合可以报销的医药目录比城镇医保要少一些，新农合在乡镇医院报销比例高，在市级医院平均报销比例比城镇医保低百分之一二十，最高封顶也比城镇医保少。

　　二、新农合报销比例是什么

　　１、村卫生室、卫生所报销比例60％；

　　２、镇卫生院报销比例40％；

　　３、二级医院搏小比例30％；

　　４、三级医院报销比例20％；

　　５、镇级合作医疗门诊报销限额5000元／年。

　　新农合住院报销比例如下：

　　１、脑电图、Ｘ光透视、拍片、化验、理疗、针灸、ＣＴ、核磁共振等辅助检查项目限额报销200元；

　　２、手术费起付线1000元内按照国家标准报销，超过1000元按照1000元报销；

　　３、60岁以上老年人住院治疗费及护理费每天可报销10元，限额200元；

　　４、各级医院报销比例为：镇卫生院报销60％，二级医院报销40％，三级医院报销30％。

　　三、新农合报销的范围有哪些

　　新型农村合作医疗报销范围为：参加人员在统筹期内因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合城镇职工医疗保险报销范围的部分（即有效医药费用）。

　　新型农村合作医疗基金支付设立起付标准和最高支付限额。医院年起付标准以下的住院费用由个人自付。同一统筹期内达到起付标准的，住院两次及两次以上所产生的住院费用可累计报销。超过起付标准的住院费用实行分段计算，累加报销，每人每年累计报销有最高限额。