烤烟苗期浇水是苗床管理的主要内容之一，与培育壮苗关系极为密切，运用水来促进或控制烟苗生长是培育壮苗重要措施。总的来说，苗期浇水应掌握小水勤浇，水量由小而大的原则。具体可以分三个阶段：

由播种至拉十字，正是种子发芽，幼苗出土，开始生长阶段。虽然需水不多，但是种子和幼根只是在床土表层，表土稍有干旱就能使发芽的种子萎缩，幼苗枯死。所以，在拉十字期前，必须经常保持床土湿润。一般是做床前浇足底水，播种后再浇一遍透水。正常浇水次数可根据具体情况来定，通常是一天浇一次，如表土湿润，也可不浇水。

从托十字到定苗，主要是幼苗伸根阶段，浇水应适当控制。每次浇水间隔时间应稍长些，苗床保持干干湿湿，有利于幼根生长，同时也能为下一阶段地上部的旺盛生长打好基础。这一阶段浇水往往是结合间苗、追肥进行。施肥后要冲洗烟苗，以防伤苗。喷药后应暂停浇水，以免药液被冲洗失效。

定苗至成苗：茎叶生长加快，需水量随之增多，同时气温升高，蒸发量加大，应增加浇水数量。但也要采取干干湿湿的浇水方法，每隔1-2天浇一次，使床面干湿交替，防止地上部茎叶徒长，以促进根系发育，使烟苗壮而墩实。

每次浇水后要进行晾床，这是十分关键的环节。浇水后晾床能提高床温，增加床土通透性，避免高温多湿，影响烟苗生长或感染病害。在移栽前一周宜少浇或不浇水，进行炼苗，使之适应移栽后的大田环境。移栽前一天为使土壤松软，便于挖垛或拔苗时多带土需浇一次大水，在拔苗前再浇一次水。