1、科属不同：问荆为木贼科问荆属中小型蕨类植物；节节草是木贼科木贼属植物节节草的全草。2、外形不同：问荆根茎斜升，直立和横走，黑棕色；节节草根茎黑褐色，生少数黄色须根。3、习性不同：问荆生于海拔0-3700米的渠旁、沙土地等处；节节草各地均有分布。4、高度不同：问荆0.6米高；节节草有1米左右高。

一、科属不同

1、问荆为木贼科问荆属中小型蕨类植物，在我国的各个省份均有分布。

2、节节草是木贼科木贼属植物节节草的全草，是我国的一种农田杂草。

二、外形不同

1、问荆：根茎斜升，直立和横走，黑棕色，节和根密生黄棕色长毛或光滑无毛。地上枝当年枯萎。枝二型。能育枝春季先萌发，高5-35厘米，中部直径3-5毫米，节间长2-6厘米，黄棕色，无轮茎分枝，脊不明显，要密纵沟，不育枝后萌发，高达40厘米，主枝中部直径1.5-3.0毫米，节间长2-3厘米，绿色，轮生分枝多，主枝中部以下有分枝。

2、节节草：根茎为深褐色，有少量黄色须根。茎直立，单生或丛生，高达70厘米，直径1-2毫米，灰绿色，肋棱6-20条，粗糙，有小疣状突起1列；沟中气孔线1-4列；中部以下多分枝，分枝常具2-5小枝。

三、习性不同

1、问荆：生于海拔0-3700米的潮湿草地、沟渠旁、沙土地、耕地、山坡和草甸等处。

2、节节草：主要生长在海拔100-3300米的湿地、溪流、海边、水田边等处，我国各个地方均有分布，随处可见。

四、高度不同

1、问荆：问荆地上茎有两种，即孢子茎和营养茎，孢子茎肉质不分枝，为紫褐色，鞘长而大。营养茎在孢子茎枯萎后出生，0.6米高，有纵棱6-15条。

2、节节草：节节草的茎分为根状茎和地上茎两部分。根状茎黑色地上茎直立，基部分枝，没有营养茎与孢子茎的区别，有1米左右高，茎中空。