性染色体（sexchromosome），与性别决定有关的染色体。自1902年麦克朗在直翅目昆虫中首次发现了性染色体后，性别决定就和性染色体紧密联系起来。高等动物有明显的性别差异，某些动物的雌体和雄体的每个细胞里，都有一对性染色体，它们的形态、大小和结构随性别的不同而不同。哺乳动物（包括人类）的雄性个体细胞中有一对大小、形态、结构不同的性染色体（XY）；雌体个体细胞中有一对形态、大小相似的性染色体（XX）。