林正英去世是因为患上了肝癌，林正英在拍戏过程中经常风餐露宿，而且压力非常大，熬夜工作是常有的事，长期下去他的身体本来就吃不消，再加上林正英本人又比较喜欢小酌几杯，如此下来他的身体出现异样，最终在1997年11月8日因肝癌去世，年仅45岁。

其实在1997年开头林正英的身体就已经出现不适，但是他热衷于拍电影，就在自己病情加重到咳血的时候他依然要坚持拍戏，在镜头前表现出很精神的一面，后来知道自己被检查出患上晚期肝癌时，他主动向女友苑琼丹提出分手不愿意耽误她的人生。

林正英的师兄弟们和洪金宝在得知他的病情后都想要去医院探望，但林正英感觉生病的样子实在太难看，他想把美好有精气神的一面留给大家，拒绝别人的探望，就连自己的儿女他也不见，在1997年11月8日林正英最终还是因为肝癌晚期去世，年仅45岁，他的葬礼用的是佛教仪式。