如果丢失部分是可以自制的原始凭证，那么可以重新自制原始凭证，并从系统中再次打印整理好记账凭证;这种情况下是公司内部的管理责任问题。如果丢失部分是发票记账联，那么可以根据公司的存根联作复印，并从系统中再次打印整理好记账凭证。公司丢失记账凭证是外部凭证，比如发票，在这种情况下，可以根据系统所查询核算信息来联系对方单位，重新复印一份作原始凭据，并再次打印整理好记账凭证。公司记账凭证丢失，可根据会计系统逐笔进行查核比对，如果是银行单据丢失的，可以联系相应的银行补打银行回单。