区分锦鲤公母时，雌锦鲤生殖孔比雄锦鲤更加扁平，而且雌锦鲤生殖孔凸起，雄锦鲤是凹陷的。雌锦鲤肚子比雄锦鲤大，而雌锦鲤头部比雄锦鲤更窄一点。雄锦鲤在生殖期时，它的鳃盖上会出现白色颗粒状的追星，雌锦鲤没有这种现象。

锦鲤分公母很简单，通常雌锦鲤生殖孔要比雄锦鲤更加扁平，并且雌锦鲤的生殖孔是凸起的，而雄锦鲤的生殖孔是凹陷的，按压还有精液流出。

雌锦鲤的肚子要比雄锦鲤更大，而且雌锦鲤头比雄锦鲤更窄一点，额头也要比雄锦鲤平缓一些，通常雄锦鲤额头是稍微凸起的。

雄锦鲤在生殖期的时候，它的鳃盖上会出现白色颗粒状的追星，但是雌锦鲤没有这种现象，而且雄锦鲤的鱼鳍也要比雌锦鲤更小一些。