大鲵一般常栖息在海拔1000米以下的溪河深潭内的岩洞、石穴之中，以滩口上下的洞穴内较为常见，其洞口不大，进出一个口；洞的深浅不一，洞内宽敞平坦。白天常卧于洞穴内，很少外出活动，夏秋季节，也有白天上岸觅食或晒太阳的习性。大鲵一般夜出晨归，常住一个洞穴。捕食主要在夜间进行，常守候在滩口乱石间，发现可猎动物经过，突然张嘴捕食。大鲵适宜栖息于水温3～23℃的水中，个体大的多生活于深水处，中小型个体多在浅水处。成鲵多数单栖活动，幼鲵常集群在乱石缝中，其生活最适水温为10～20℃。大鲵常将头部伸到水面进行呼吸，皮肤也是它气体交换的重要器官，在含氧量较高的水中，大鲵可较长时间伏于水底不浮出水面呼吸。在人工饲养情况下，每6～30分钟将鼻孔伸出水面呼吸一次，吸气约几秒至数10秒。