蒜瓣休眠是指蒜头成熟后进入休眠状态，这段时间称为大蒜的生理休眠。生理休眠是大蒜对外界不良条件的一种适应，也是常规贮藏的基础。在大蒜的生理休眠期，即使提供大蒜适宜的温度和湿度，蒜瓣也不会萌芽发根。随着休眠期的渐渐通过，进入休眠中后期后，鳞片组织胞核体积增大，核与胞质的分界变得模糊不清，此时蒜瓣中央缝隙不断扩展，发展成较宽阔的通道，中央孔道的出现是部分薄壁细胞组织消融的结果，为潜伏幼芽转而生长提供必要的营养和通道。