因为近亲结婚的夫妻双方有共同的祖先和若干个相同基因（包括病态基因），当双方病态基因相遇，就使得下一代的先天性缺陷或遗传病的发病率高于非近亲结婚，且死亡率也比非近亲结婚的高两倍多。

1、近亲结婚的夫妻双方有共同的祖先，有若干相同的基因（包括病态基因），当双方病态基因相遇，会使得后代的先天性缺陷或遗传病显现出来。

2、近亲结婚生育后代的遗传病发病率高于非近亲结婚。如肝豆状核变性在一般婚配的后代中，患病机会仅仅是四百万分之一，而在表兄妹结婚的后代中，高达六十四分之一，近亲结婚后代的遗传病发病率比非近亲结婚高150倍。另外，近亲结婚的子女出生死亡率也比非近亲结婚的高两倍多。

因此，近亲不能结婚是有科学道理的。