起源时间不同：公主从春秋战国时就出现。格格最早出自后金。

封号不同：公主的封号通常有以郡县名、以国名、以美名。顺治十七年把“格格”分为亲王之女、世子及郡王之女、多罗贝勒之女、固山贝子之女、镇国公、辅国公之女。

地位不同：清朝时公主通常为皇帝之女，只有一部分是为与满蒙联姻而册封的亲王王爷之女。“格格”专指王公贵胄之女，另外清朝亲王的低阶妾有时也被叫做格格。因此公主的地位高于格格。