1、作用不同：分拨中心是物流行业运作的经济活动组织。它是集加工、理货、送货等多种职能于一体的物流据点。转运中心指以专门承担货物的卡车与卡车、卡车与火车、火车与轮船、卡车与飞机等不同运输方式的转运任务的物流中心。

2、运作方式不同：分拨中心的服务对象是为数众多的生产企业和商业网点，分拨中心的作用是按照用户的要求，及时将各种已经配装好的货物送交到用户手中，满足生产和消费的需要。转运中心是实现不同运输方式或同种运输方式联合（接力）运输的物流设施，通常称为多式联运站、集装箱中转站、货运中转站等。转运中心多分布在综合运网的节点处、枢纽站等地域。

3、职能不同：在配送实践中，分拨中心凭借其特殊的地位和其所拥有的各种先进的设备手段，能够将分散在各个生产企业的产品（即货物）集中在一起，而后，经过分拣、配装向众多用户发运。转运中心的职能是将货物集散与配载，集零为整、化整为零，针对不同目地进行配载作业。