1、植物种类不同：燕麦是禾本科、燕麦属植物；小麦是禾本科、小麦属植物。

2、食用方式不同：燕麦的谷粒供磨面食用，或作饲料，主要是加工成燕麦片熬粥或者其他燕麦制品；小麦的谷粒磨成面粉后可制作面包、馒头、饼干、面条等食物，发酵后可制成啤酒、酒精、白酒（如伏特加），或生物质燃料。

3、果实不同：燕麦的果实腹面有纵沟，被有稀疏的茸毛，果实粉末为介于灰色与米色之间；小麦的果实呈扁圆形或椭圆形，颜色为黄棕色，两端稍微尖锐或是钝圆形，果实粉末为白色。