部分品种的鳄鱼是保护动物。鳄鱼有很多种种类，并不是所有的都是保护动物，一般数量较少濒临灭绝的则是保护动物。扬子鳄、中美短吻鳄、南美短吻鳄、窄吻鳄、尖吻鳄、中介鳄、菲律宾鳄、马来鳄、食鱼鳄等属于濒危野生动植物种，是国际性重要保护物种，被《华盛顿公约》CITES列入附录I名单，禁止其国际贸易。

鳄鱼为肉食性卵生脊椎类爬行动物，是两亿多年前与恐龙同时代的最古老爬行动物，也是迄今生存着的最原始动物之一。 鳄鱼因强盛的生命力而生存和繁衍，成为地球上最古老的生物“活化石”之一。鳄鱼属于濒危野生保护动物，被国际上列为 I 类保护的濒危野生动植物。我国特产的扬子鳄 （亦称中华鳄 Alligator sinensis）被列为国家一级野生保护动物。2003 年国家林业局批准了尼罗鳄、湾鳄和暹罗鳄 （俗称泰国鳄）等 3 种鳄鱼列入首批 54 种可商业利用的野生动物。