上海海事大学的专业排名中，航海技术、轮机工程、交通运输、物流管理、法学、工业工程、物流工程、交通工程、交通管理、经济学等排名前列。特别是物流管理专业，已成为国家第一批特色专业。该专业注重培养既拥有扎实的管理学和经济学综合基础理论知识、物流管理和交通运输等方面的专业基础理论知识，又具备较强的利用新技术手段进行优化决策的能力和面向企业的实践应用能力。