1、含义不同：“鱼龙混杂”比喻好人和坏人混杂在一起。“鱼目混珠”用来比喻以假乱真，以次充好，它适用的对象一般是物（事），不是人。

2、出处不同：“鱼龙混杂”出自唐·张志和《和渔夫词》，“鱼目混珠”出自晋·卢谌《赠刘琨》。

3、鱼龙混杂造句：

九龙城是个鱼龙混杂之区，你到了那里之后，要特别当心。

在革命的浪潮中，难免泥沙俱下，鱼龙混杂。

4、鱼目混珠造句：

他鉴别古代的图书版本有丰富的经验，要想鱼目混珠，那比登天还难。

商品鱼目混珠之事甚多，验货物应小心，否则会招来重大损失。