iPhone6s能升级13.4系统，但不建议升级，新系统增加的功能虽然较多，但系统和硬件不兼容，都容易造成卡顿、死机的情况。

北京时间2015年9月10日发布iPhone 6S Plus。除了原有的 金色， 银色，深空灰并推出 玫瑰金（粉色），屏幕采用高强度的Ion-X玻璃，处理器采用A9+M9处理器，CPU性能比A8提升70%，图形性能提升90%，后置摄像头1200万像素，前置摄像头500万像素。摄像头对焦更加准确，CMOS为了降噪采用“深槽隔离”技术，支持4K视频摄录。数据连接方面，支持23个频段的LTE网络，和2倍速度的WIFI连接。2015年9月25日发售。