一、员工合同纠纷怎么处理

因劳动合同产生劳动争议的，由用人单位和劳动者协商处理，如果协商不成的，可以申请劳动仲裁。

《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》

第二条　中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：

(一)因确认劳动关系发生的争议；

(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；

(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议；

(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议；

(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议；

(六)法律、法规规定的其他劳动争议。

第五条　发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。

二、劳动仲裁流程是怎样的

1、劳动保障当事人提出仲裁的，应当从劳动争议发生之日起一年内仲裁委员会提出书面申请。

2、仲裁委员会应当自收到申诉之日起五日内作出受理或不受理的决定。受理的，应当由作出决定之日起五日内，将申请书副本送达被申请人，并组成仲裁庭，决定不予受理的，应当书面作出不予受理通知，说明不予受理的理由。被申请人应当自收到申请书副本之日起十日内提交答辩书及相关证据。被诉人没有按时提交或不提交答辩书的，不影响案件审理。

3、仲裁庭应当于开庭五日前，将开庭时间、地点的书面通知送达当事人。当事人收到书面通知，无正当理由，拒不到庭或者未经仲裁庭同意，中途退庭的，对申请人按撤诉处理，被申请人可以缺席裁决。

4、仲裁庭处理劳动争议案件，应当自组成仲裁庭之日起四十五日内结案，案情复杂确需延期的，经报仲裁委员会批准，可以适当延期，但不得超过十五日。

5、仲裁庭处理劳动争议应先行调解，调解达成协议的，仲裁庭应当根据协议内容制作调解书，调解书自送达之日起具有法律效力。

6、当事人对仲裁裁决不服的，自收到裁决书之日起十五日内，可以向人民法院起诉，期满不起诉的，裁决书即发生法律效力。

7、当事人对发生法律效力的调解书和裁决书，应当依照规定的期限履行。一方当事人逾期不履行的，另一方可以申请人民法院强制执行。

员工合同纠纷发生之后一定要及时的处理解决，可以协商处理，如果当事人不愿意协商的，也可以走仲裁的方式解决，一般处理劳动纠纷都必须要先仲裁才能向法院提起诉讼 ，所以，在处理之前必须要多方面的收集证据，只有获得执法人员受理，才能更好的保障到自己的权益。