1、票面的区别：增值税发票为可抵扣发票，有“增值税专用”字样，增值税专用发票是三联式的，普通发票则有“增值税普通发票”字样，普通发票两联。
2、发票使用的主体不同：增值税专用发票一般只能由增值税一般纳税人领购使用，小规模纳税人需要使用的，只能经税务机关批准后由当地的税务机关代开；普通发票一般纳税人与小规模纳税人都可以使用，未办理税务登记的纳税人也可以向税务机关申请领购使用普通发票。
3、发票的内容不同：增值税专用发票除了具备购买单位、销售单位、商品或者服务的名称、商品或者劳务的数量和计量单位、单价和价款、开票单位、收款人、开票日期等普通发票所具备的内容外，还包括纳税人税务登记号、不含增值税金额、适用税率、应纳增值税额等内容。
4、发票联次不同：增值税专用发票有四个联次和七个联次两种，一联为存根联，二联为发票联，三联为抵扣联，第四联为记账联，七联次的其他三联为备用联，而普通发票则只有三联，第一联为存根联，第二联为发票联，第三联为记账联。
5、作用不同：对于开票企业则没有区别，不管是哪类票都要缴纳销项增值税，但对于受票企业，只要增值专用发票才可以抵扣，普通发票则不可以。
《中华人民共和国发票管理办法》第十四条