1、适用特别程序审理的案件，其目的不是解决双方当事人之间的民事权益冲突，而是确认某种法律事实是否存在，权利状态的有无或公民是否享有某种资格，能否行使某种权利。
法院在依照特别程序审理案件的过程中，发现本案属于民事权益争议的，应裁定终结特别程序，并通知利害关系人可另行起诉。
2、启动特别程序的当事人比较特殊。特别程序可基于申请人的申请而开始；起诉人或者申请人不一定与本案有直接利害关系。这与普通程序具有明显的区别，在普通诉讼程序中，起诉的原告必须是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织，与本案没有直接利害关系的公民、法人和其他组织不得提起诉讼，不能做符合条件的原告。
3、审判组织特殊。与审理民事争议案件的审判组织相比，根据特别程序审理案件的审判组织较为特别。例如审理选民资格案件或者重大疑难的其他案件，必须是由审判员组成合议庭审理。除此之外的其他按特别程序审理的案件，由独任制法庭审理。而在普通程序中民事案件一般由合议 制法庭审理，合议庭可由审判员组成，也可由审判员和陪审员组成。根据简易程序审理的简单民事案件，由独任制法庭审理。
4、实行一审终审制度。人民法院依照特别程序审理案件，实行一审终审制，判决书一经送达，即发生法律效力，当事人不得对之声明不服，不得提起上诉。而在普通程序、简易程序中，对于民事案件的审理一般实行两审终审制，如果当事人不服第一审法院的判决，可依法向原审法院的上一级法院即二审法院提起上诉，二审法院的判决是终审判决。
5、审理期限较短。根据民事诉讼法的规定，按特别程序审理的案件，应当在立案之日起30日内或公告期满后30日内审结，有特殊情况需要延长的，由本院院长审批。但选民资格案件必须在选举日之前审结，不得延长到选举日后审结。在普通程序中，对于民事案件的审理期限一般较长。根据民事诉讼法的规定，适用普通程序审理一审案件，应在立案之日起6个月内审结，有特殊情况需要延长的，由本院院长批准，可延长6个月，还需要延长的，报上级法院院长批准。对上诉案件，应当在第二审法院立案之日起3个月内审结，有特殊情况需要延长的，由本院院长批准。对裁定不服提起上诉的案件，应当在第二审法院立案之日起30日内作出终审裁定。
6、免交案件受理费。根据特别程序审理的案件，不论当事人的情况如何，一律免交案件受理费。而在普通程序中，一般需要交纳案件受理费。如果需要免交，则要求当事人证明交纳诉讼费用确有困难，并提出免交的申请，由受诉法院审查决定。对于那些确有困难，无力交纳的当事人，可批准免交；反之，对于那些有能力交纳的当事人，不批准免交。